Les instances
La MSHE est unité d'appui et de recherche (UAR3124) sous tutelle du CNRS et de l’Université Marie et Louis Pasteur. Elle est aussi une fédération de recherche (FED 4209), reconnue par le ministère de l’Enseignement supérieur et de la recherche depuis le 1er janvier 2012. Elle fédère les unités de recherche francs-comtoises du domaine des sciences humaines et sociales (SHS) ou comportant une équipe SHS en leur sein.
La MSHE est l’une des unités du Réseau national des Maisons des Sciences sociales et des Humanités (RnMSH) et en respecte la charte. Au niveau régional, la MSHE a mis en place, avec la Maison des sciences sociales et des humanités de Dijon, la Fédération des MSH de Bourgogne Franche-Comté, pour concrétiser les collaborations anciennes développées entre les deux maisons.
Le conseil de laboratoire regroupe l'ensemble des agents de la MSHE, les responsables de pôles et de plateformes.
