Dans le cadre de la Fédération des Maisons des Sciences de l'Homme de Bourgogne et de Franche-Comté, la MSHE Claude Nicolas Ledoux de Franche-Comté et la MSH de Dijon ont lancé conjointement un appel à projets destiné prioritairement à favoriser l'émergence de nouveaux projets de recherche pour alimenter l'axe transversal « Transmission, Travail, Pouvoirs » qu'elles souhaitent mettre en place. 
le 16 mars 2016 - Conférence par Vincent Guilin (UQAM, Québec), organisée par le Laboratoire de l'Agir et la MSHE C. N. Ledoux. Epistémiologie générale.
De jeunes chercheurs de la MSHE Ledoux ont mené début 2016, aux États-Unis, une campagne de numérisation 3D sur un lot de céramiques romaines provenant des réserves des Musées Capitolins de Rome, en collaboration avec des universités nord-américaines.
Une 4ème session de l'Ecole thématique CNRS en « Méthodes Informatiques et Statistiques en Analyse de Textes » aura lieu du 19 au 24 juin 2016 près de Besançon. L'objectif scientifique de l'école MISAT est de permettre une réflexion sur les corpus textuels numériques et la maîtrise d'outils informatiques et statistiques pour leur traitement.
Cet ouvrage dirigé par Pierre et Anne-Marie Pétrequin, est une monographie archéologique de trois villages néolithiques du lac de Clairvaux (Jura), replacés dans le contexte social, culturel et chronologique de la première moitié du IVe millénaire av. J.-C. au nord-ouest des Alpes.
Le dernier numéro de cette revue en ligne de sciences humaines et sociales hébergée par la MSHE Ledoux, porte sur « La part de la main ».
Cet ouvrage dirigé par Edward Castleton, chercheur associé à la MSHE et Hervé Touboul, maître de conférences à l'Université de Franche-Comté, vise à retracer les prises de position et interprétations différentes de quelques observateurs les plus connus (Balzac, Flaubert, Hugo, etc.) de la révolution de 1848 en France.
Aux éditions "érès"
L'année internationale de la lumière a été fêtée à l'occasion de la fête de la Science. Cette année, le Village des sciences était implanté sur le site des Près de Vaux à Besançon, au milieu des installations artistiques. Une trentaine de structures ont participé à la fête dont la MSHE C. N. Ledoux. Cétait l'occasion de rencontrer les chercheurs, de découvrir leur travail ainsi que leurs outils : drône, scanner 3D, tachéomètre robotisé... !
André DIDIERJEAN, directeur adjoint de la MSHE et professeur de psychologie cognitive à l'Université de Franche-Comté, a publié aux éditions du Seuil « La madeleine et le savant. Balade proustienne du côté de la psychologie cognitive ». Il parle de son ouvrage dans l'émission de France Inter "Ca va pas la tête".
Le second numéro de la Newsletter du PS-ICU group (Perceived Stress in Intensive Care Unit) est paru.
A l'occasion du changement de directeur de la MSHE Ledoux, une cérémonie de succession a été organisée le 9 septembre 2015, devant un public de partenaires institutionnels et d'acteurs du monde de la recherche et du domaine socio-économique, en présence de Madame la Présidente de région Franche-Comté, de M. le représentant du Maire de Besançon, délégué à la requalification urbaine, de M. le recteur de l'académie de Besançon, chancelier des universités, et de M. le délégué régional à la recherche et à la technologie.
Volume collectif paru aux éditions La Découverte, réalisé sous la co-direction de chercheurs de la MSHE Ledoux, dans le cadre du projet ANR "Utopies 19" dont elle est partenaire.
Ce volume contient les Actes de la Journée d'étude organisée à Lons-le-Saunier, le 4 octobre 2014, par Franche-Bourgogne, le groupe de recherches historiques sur le comté de Bourgogne, avec le soutien du Laboratoire chrono-environnement de l'Université de Bourgogne/Franche-Comté et des Archives départementales du Jura.
Jeudi 9 juillet 2015, une visite du chantier de la Maison des Sciences de l'Homme et de l'Environnement (MSHE) Claude Nicolas Ledoux a été organisée, en présence des financeurs du projet (Région Franche-Comté, Ville de Besançon, Université de Franche-Comté et Etat), pour faire le point sur l'avancement des travaux,
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